ABSTRACT Microorganisms play a key role in determining the terroir of any region where vineyards are cultivated, influencing the characteristics of the wine produced in that region. This study aimed to determine the mycobiota terroir of Syrah grapes from subtropical vineyards of southern Minas Gerais, Brazil, using independent cultivation methods. Total DNA was extracted from the grapes and internal transcribed spacer/rRNA regions were sequenced. Taxonomic profiles were obtained at the kingdom, phylum, class, order, family, genus, and species levels. The results showed a predominance of the phylum Ascomycota, followed by Basidiomycota. A phylogenetic tree was also constructed with the top 20 species of fungi present in the grapes, mainly represented by the genera Cercospora, Uwebraunia, Aureobasidium, Leptospora, Pseudopithomyces, Periconia, Acrocalymma, Alternaria, Aspergillus, Penicillium, Hansfordia, Meyerozyma, Candida, Wickerhamomyces, Acremonium, Sarocladium, Gibberella, and Colletotrichum. The fungal diversity of the grapes was successfully characterized, but many individuals were not classified, indicating that future studies should be performed to better understand the profile of the species found, as well as their functions in this system.

RESUMO Os microrganismos desempenham um papel fundamental na determinação do terroir da região onde os vinhedos são cultivados, influenciando as características do vinho produzido nessa região. Nesse sentido, este estudo teve como o objetivo determinar a micobiota terroir de uvas variedade Syrah de vinhedos sub-tropicais localizados no sul de Minas Gerais. O material genético foi extraído para a obtenção do DNA total e seu sequenciamento foi realizado pelo programa Illumina, usando a região ITS rRNA. Perfis taxonômicos foram obtidos em Domínio, Filo, Classe, Ordem, Família, Gênero e Espécie, observando-se que houve uma maior predominância do filo Ascomycota, seguido de Basidiomycota. Também foi construída uma árvore filogenética com as 20 principais espécies de fungos presente nas uvas, respresentadas pelos gêneros Cercospora, Uwebraunia, Aureobasidium, Leptospora, Pseudopithomyces, Periconia, Acrocalyma, Alternaria, Aspergillus, Pecinicillium, Hansfordia, Meyerozyma, Candida, Wickerhamomyces, Acremonium, Sarocladium, Giberella e Colletotrichum. A caracterização da diversidade microbiana das uvas foi obtida com sucesso, no entanto, pôde-se observar um grande número de indivíduos que não foram classificados, levando a crer que estudos futuros nessa área precisam ter continuidade para que, cada vez mais, possamos ter conhecimento dessas espécies e entender como funcionam esses sistemas.

Resumo Neste estudo, caracterizaram-se os compostos fenólicos e avaliou-se a atividade antibacteriana de extratos obtidos da farinha da casca de jabuticaba (FCJ). Os compostos fenólicos da FCJ foram extraídos de quatro formas: a) extrato acetônico - 1 g FCJ: 10 mL acetona 70%, duas horas em repouso; b) extrato aquoso - 1 g FCJ: 15 mL água, sob agitação; c) extrato etanólico - 1 g FCJ: 15 mL etanol acidificado, sob agitação; e d) extrato metanólico - 1 g FCJ: 50 mL metanol 50%, sob refluxo. A atividade antibacteriana foi avaliada pela técnica de difusão cavidade em Ágar, utilizando-se os microrganismos Escherichia coli ATCC 11229, Salmonella cholerasuis ATCC 6539, Pseudomonas aeruginosa ATCC 15442, Staphylococcus aureus ATCC 6538 e Listeria monocytogenes ATCC 19117. Os extratos etanólico e metanólico apresentaram os teores mais elevados de compostos fenólicos, sobretudo o cloreto de cianidina, catequina e epicatequina. Os extratos não inibiram o crescimento de Escherichia coli e Salmonella choleraesuis, mas inibiu em 30% o crescimento de Pseudomonas aeruginosa na concentração do extrato de 250 µg mL-1. A maior inibição de crescimento registrada foi de 41,8% pelo extrato etanólico, seguida pela inibição de 36% pelo extrato metanólico, contra as bactérias Staphylococcus aureus e Listeria monocytogenes, revelando assim a potencialidade destes extratos como possível alternativa para utilização na indústria de alimentos e/ou farmacêutica.

Abstract The phenolic compounds from various extracts of jabuticaba skin powder (JSP) were characterized in this study, and the antibacterial activity assessed. The phenolic compounds were extracted from the JSP using four methods: a) acetone extraction - 1 g JSP: 10 mL 70% acetone, resting for 2 hours; b) aqueous extract - 1 g JSP: 15 mL water, under agitation; c) ethanolic extract - 1 g JSP: 15 mL acidified ethanol, under agitation; and d) methanolic extract - 1 g JSP: 50 mL 50% methanol, under reflux. The antibacterial activity was evaluated by the agar diffusion assay, using Escherichia coli ATCC 11229, Salmonella choleraesuis ATCC 6539, Pseudomonas aeruginosa ATCC 15442, Staphylococcus aureus ATCC 6538 and Listeria monocytogenes ATCC 19117. The ethanolic and methanolic extracts showed the highest levels of phenolic compounds, especially of cyanidin chloride, catechin and epicatechin. The extracts did not inhibit the growth of Escherichia coli and Salmonella choleraesuis, but inhibited 30% of the growth of Pseudomonas aeruginosa with an extract concentration of 250 µg mL-1. Against Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes the highest inhibitory effect observed was 41.8% for the ethanolic extract, followed by 36% inhibition by the methanolic extract, thus revealing the potential of these extracts as possible alternatives for use in the food and/or pharmaceutical industries.

O Brasil tem uma grande biodiversidade no bioma Cerrado típico de savanas tropicais. Os objetivos deste estudo foram isolar e identificar bactérias celulolíticas e pectinolíticas e com atividade antagonista contra contra Aspergillus. carbonarius produtores de ocratoxina a partir de Psychotria hoffmannseggiana. Frutos maduros de P. hoffmannseggianaforam coletadas na região da cidade de Passos em área preservada de Cerrado em Minas Gerais, Brasil. Realizou-se diluições decimais e as bactérias isoladas foram caracterizados bioquimicamente e identificadas por seqüenciamento. Para a produção de enzimas, as bactérias foram cultivadas em CMC e MP5 e MP7. Os isolados com melhor produção enzimática foram submetidos ao processo de otimização. A atividade antagonista foi realizada em co-cultura (bactérias e fungos filamentosos) e avaliou-se o crescimento e a esporulação. TLC foram realizados para verificar a produção de micotoxinas. A microbiota predominante foi Gram negativas pertencem à família Enterobacteriaceae. Alguns isolados apresentaram potencial para a atividade enzimática e antagonista, especialmente o isolado identificado como Lysinibacillus fusiformis. Esta espécie foi melhor produtora de celulases (atividade máxima 103,1 mg glicose min.-1 mg-1 de proteína). Três dos 105 isolados de bactérias estimularam a produção de micotoxinas. Conclui-se que estes isolados apresentam potencial biotecnológico para a área de agro-indústria e meio ambiente.

Brazil has great biodiversity, which is observed in the Cerrado biome of the tropical Brazilian savanna. The objectives of this study were to isolate and identify bacteria from Psychotria hoffmannseggiana with potential cellulase and pectinase production and with antagonistic activity against Aspergillus carbonarius, an Ochratoxin A (OTA) producer. Ripe fruit were collected in the region of Passos City in the preserved Cerrado area in Minas Gerais State, Brazil. Serial dilutions were performed, and the bacteria isolated were biochemically characterized and identified by sequencing. To analyze the production of enzymes, the bacteria were cultivated in CMC and pectinase media. The better enzyme producers were optimized for production. Assays on the antagonistic activity for growth and sporulation were carried out in co-culture (bacteria and filamentous fungi). TLC was performed to verify the mycotoxin production. The predominant microbiota were Gram-negative bacteria belonging to the Enterobacteriaceae family. Some isolates showed potential for enzymatic and antagonistic activity, especially the isolate identified as Lysinibacillus fusiformis. This species was a better producer of cellulases (maximum activity: 103.1 mg glucose min.-1 mg-1 protein). In conclusion, the bacteria isolated from Psychotria hoffmannseggiana showed biotechnological potential for agro-industry and the environmental aspect.

This study was conducted to evaluate the physicochemical and microbiological characteristics of raspberries exposed to different radiation doses. The fruits were harvested in the city of Campestre, MG, packed in polyethylene bags, and transported to the Federal University of Lavras (UFLA), where they were separated into 4 lots. Irradiation was performed at the Center for Development of Nuclear Technology in Belo Horizonte, MG. The doses used were 0 (control), 0.5, 1.0, and 2.0 kGy. After irradiation, the fruits were transported back to UFLA and stored at 1 ºC and 95% relative humidity (RH) for 12 days. The physicochemical analyses for mass loss, total soluble solids, titratable acidity, pH, total soluble sugars, total soluble pectin, firmness, vitamin C content, total antioxidant activity, and total phenolic, and the microbiological assays (coliform at 35 and 45 ºC, psychrotrophic and filamentous fungi and yeasts) were performed after 0, 3, 6, 9, and 12 days of storage. Lower loss of mass and filamentous fungi and yeast count were observed in the irradiated fruits, and 2 kGy was determined as the most effective dose for microbial control, but this irradiation dose also resulted in increased loss of fruit firmness.

As micotoxinas são produzidas pelo metabolismo secundário de várias espécies de fungos e podem ser encontradas em quase 25% das commodities agrícolas. Esses compostos são tóxicos a humanos, animais e plantas e, portanto, esforços para evitar a contaminação de micotoxinas em alimentos e rações devem ser feitos. Além disso, até 25% das frutas e legumes em pós-colheita são perdidos em decorrência do ataque de fungos de armazenamento e/ou contaminações por micotoxinas. Vários métodos têm sido aplicados para mitigar os problemas de micotoxinas, mas a maioria deles se baseia no uso de fungicidas. Embora os produtos químicos sejam, muitas vezes, a primeira estratégia de defesa contra fungos micotoxigênicos, o uso indiscriminado de fungicidas vem despertando a percepção pública, em razão de seus efeitos nocivos sobre o meio ambiente e à saúde humana/animal. Assim, existe uma crescente pressão pública em busca de alternativas mais segura e não nocivas ao meio ambiente para controlar estes organismos. Nesse contexto, o controle biológico utilizando antagonistas microbianos, tais como bactérias, fungos e leveduras têm mostrado ser um substituto viável para reduzir a utilização de produtos químicos. Apesar dos resultados positivos, usando os agentes de controle biológico, poucos produtos apenas foram registrados e estão comercialmente disponíveis para controlar fungos produtores de micotoxinas. Esta revisão traz estratégias de controle biológico para evitar ou reduzir danos em commodities agrícolas causadas por fungos de armazenamento e a contaminação de alimentos e rações por micotoxinas.

Mycotoxins are produced by the secondary metabolism of many fungi and can be found in almost 25% of the world's agricultural commodities. These compounds are toxic to humans, animals, and plants and therefore, efforts should be made to avoid mycotoxin contamination in food and feed. Besides, up to 25% of all harvested fruits and vegetables are lost due to storage molds and/or mycotoxin contamination and many methods have been applied to mitigate these issues, but most of them rely on the use of fungicides. Although chemicals are often the first defensive line against mycotoxigenic fungi, the indiscriminate use of fungicides are awakening the public perception due to their noxious effects on the environment and human/animal health. Thus, there is an increasing public pressure for a safer and eco-friendly alternative to control these organisms. In this background, biological control using microbial antagonists such as bacteria, fungi and yeasts have been shown to be a feasible substitute to reduce the use of chemical compounds. Despite of the positive findings using the biocontrol agents only a few products have been registered and are commercially available to control mycotoxin-producing fungi. This review brings about the up-to-date biological control strategies to prevent or reduce harvested commodity damages caused by storage fungi and the contamination of food and feed by mycotoxins.

Diversos fatores podem interferir na qualidade do café, especialmente aqueles relacionados às etapas pós-colheita de processamento e secagem. Algumas espécies de fungos podem se associar a grãos de café durante a pós-colheita, podendo ocasionar alterações indesejáveis. O objetivo deste estudo foi avaliar a influência dos processamentos via seca (natural), seco em terreiro de terra, e via úmida (despolpado), seco em terreiro de cimento, tradicionalmente empregados na região sudoeste da Bahia, na incidência de fungos em grãos de café beneficiados produzidos na safra 2007/2008. O experimento consistiu de 4 tratamentos: a) café natural de Barra do Choça; b) café natural de Encruzilhada; c) café despolpado de Barra do Choça e d) café despolpado de Encruzilhada; e 5 repetições. Foram coletadas 20 amostras de grãos de café oriundas de diferentes propriedades cafeeiras nestes municípios. Os resultados obtidos foram avaliados pelo teste de médias t de Bonferroni a 5% de probabilidade. Houve diferença estatística significativa entre os tratamentos analisados para a infestação fúngica. Os gêneros detectados foram: Aspergillus, Penicillium e Fusarium, sendo que o gênero Aspergillus foi o de maior incidência, no qual foram identificadas oito espécies: Aspergillus ochraceus, A. niger, A. flavus, A. foetidus, A. tubingensis, A. auricomus, A. sojae e A. oryzae. Foi detectada a maior incidência de fungos em grãos de café oriundos de processamento natural do que de processamento despolpado.

Several factors can affect the quality of coffee, especially those related to the post-harvest stages of processing and drying. Some fungal species can associate with coffee beans during post-harvest, leading to undesirable alterations. The aim of this study was to evaluate the influence of dry (natural) processing, on-land drying, and humid (pulped) drying on cement floors, which are methods traditionally used in the southwestern region of Bahia State, Brazil, on the incidence of fungi on benefited coffee beans produced in the 2007/2008 harvest. The experiment consisted of 4 treatments: a) natural coffee of Barra do Choça; b) natural coffee of Encruzilhada; c) pulped coffee of Barra do Choça and d) pulped coffee of Encruzilhada; and 5 replicates. Twenty samples of coffee beans were collected from different coffee growers in the above-mentioned cities. Results were evaluated using Bonferroni's T test at 5% probability. Significant differences were found between the analyzed treatments for fungal infestation. The genera of detected fungi were: Aspergillus, Penicillium and Fusarium, and Aspergillus had the highest incidence, with eight species identified: Aspergillus ochraceus, A. niger, A. flavus, A. foetidus, A. tubingensis, A. auricomus, A. sojae and A. oryzae. The incidence of fungi was higher in naturally processed than in pulped coffee beans.

Neste trabalho, avaliou-se a capacidade fungitóxica do óleo essencial de folhas frescas de Tanaecium nocturnum sobre o Aspergillus flavus isolado da castanha-do-brasil, por meio das técnicas de contato e fumigação. Pelos resultados dos bioensaios realizados até 10 dias de incubação, verificou-se que a inibição total do crescimento micelial ocorreu quando se utilizou o óleo essencial nas concentrações de 782 ppm (técnica de contato) e 1000 ppm (técnica de fumigação). Em ambas as técnicas, o óleo essencial inibiu a esporulação a partir da concentração de 500 ppm. Observou-se que nos cinco primeiros dias de incubação não houve diferença significativa nos resultados apresentados pelas duas técnicas estudadas, havendo a partir daí uma redução da atividade do óleo essencial nas concentrações inferiores a 1000 ppm pelo teste de fumigação. A ação fungitóxica do óleo essencial sobre o microrganismo estudado pode ser atribuída à presença do benzaldeído (composto majoritário do óleo essencial estudado), em associação com outros compostos também presentes nesse óleo essencial, tais como; álcool benzílico, benzoato de benzila e mandelonitrila.

The present work sought to evaluate the fungitoxic activity of the essential oil from fresh Tanaecium nocturnum fresh leaves on Aspergillus flavus isolated from Brazil nuts, using contact and fumigation techniques. The results of bioassays performed up to 10 days of incubation demonstrated that total inhibition of mycelial growth occurred when using the essential oil at concentrations of 782 ppm (contact technique) and 1000 ppm (fumigation technique). In both techniques, the essential oil inhibited the formation of spores at the concentration of 500 ppm. No significant difference in the results presented by the two techniques was observed in the first five days of incubation. After this period, the essential oil showed a reduction in activity at concentrations lower than 1000 ppm in the fumigation test. The fungitoxic activity of the essential oil on the organism studied can be attributed to the presence of benzaldehyde (major component of the essential oil), in combination with other compounds also present in this oil, such as, benzyl alcohol, benzyl benzoate and mandelonitrila.

O aumento do consumo de produtos de origem natural tem ocasionado problemas de saúde pública devido ao risco da contaminação fúngica e a possível presença de micotoxinas. Objetivou-se, neste estudo, identificar as espécies fúngicas com potencial micotoxigênico e avaliar o efeito da irradiação gama (60Co) na destruição da microbiota fúngica natural de cinco plantas medicinais: Alcachofra (Cynara scolymus L.), Boldo (Peumusboldus Molina), Camomila (Matricaria recutita L.), Chapéu de couro (Echinodorusgrandiflorus Micheli) e Sene (Cassia acutifolia Delile). A quantificação de fungos filamentosos e leveduras foi efetuada pela Técnica de Diluição Seriada em meio DRBC. Em Camomila foram identificados 8 isolados de Aspergillus flavus, sendo 2 (25%) produtores de aflatoxina B1 e B2 e 5 isolados de Aspergillus ochraceus, sendo 2 (40%) produtores de ocratoxina A. Em Alcachofra foi identificado 1 isolado de Aspergillus ostianus produtor de ocratoxina A. Observou-se redução total da contagem de fungos em Boldo a partir de 3 kGy e em Chapéu de couro e Sene a partir de 5 kGy. Em Alcachofra, a contagem inicial de 5,0 x 10(6) UFC/g foi reduzida para 3,5 x 10² UFC com dose de 10 kGy. Nessa mesma dose a contagem fúngica em Camomila foi reduzida de 3,0 x 10(5) UFC/g para 2,2 x 10³ UFC/g.

The increasing consumption of natural products has brought about problems related to public health due to the risk of fungi contamination and the considerable possibility of mycotoxin presence. The aim of this work was to identify the fungi species with mycotoxigenic potential and to evaluate the effect of gamma irradiation (60Co) on killing the natural fungi microbiota of five medicinal plants: artichoke (Cynara scolymus L.), boldo (Peumusboldus Molina), chamomile (Matricaria recutita L.), burhead (Echinodorusgrandiflorus Micheli), and senna (Cassia acutifolia Delile). The qualification of filamentous fungi and yeast was carried out utilizing the Technique of Serial Dilutions on DRBC medium. Eight isolates of Aspergillus flavus were identified onchamomile, two (25%) beingproducers of aflatoxins B1 and B2 as well as five isolates of Aspergillus ochraceus, two (40%) being producers of ocratoxin. On artichoke, one isolate of Aspergillus ostianus was identified as ocratoxin A producer. A reduction on the total counting of fungi was observed in boldo with irradiation higher than 3 kGy, and in both burhead and senna with irradiation higher than 5 kGy. The initial counting on artichoke of 5.0 x 10(6) CFU/g experienced a reduction to 3.5 x 10² with doses of 10 kGy. With this same dose the fungi counting on chamomile was reduced from 3.0 x 10(5) CFU/g to 2.2 x 10³ CFU/g.

O objetivo deste estudo foi isolar e caracterizar fungos filamentosos presentes em diferentes estágios de beneficiamento de café processado pelo método natural, incluindo: colheita, fermentação, secagem e armazenamento. O café cereja foi colhido manualmente e então colocado em uma plataforma de cimento, onde permaneceu até atingir 11% de umidade. A contagem microbiana foi realizada em todas as amostras durante a fermentação e secagem do café. A população de fungos filamentosos no café cereja ainda nos pés (tempo 0) foi em torno de 1,5 x 10³ UFC/g. Este número aumentou vagarosamente durante a fermentação e secagem, alcançando valores de 2 x 10(5) UFC/g em 22 dias do processamento. Duzentos e sessenta e três isolados de fungos filamentosos foram identificados. A distribuição das espécies durante fermentação e secagem foi bastante variada, mas no armazenamento dos grãos ocorreu o predomínio de espécies de Aspergillus. Foram encontradas 38 espécies de fungos distribuídas nos seguintes gêneros: Pestalotia (4), Paecelomyces (4), Cladosporium (26), Fusarium (34), Penicillium (81) e Aspergillus (112).

The objective of this work was to isolate and characterize filamentous fungi present in different stages of harvest, fermentation, drying and storage of coffee beans processed by natural method. The cherries were hand-picked and then placed on a cement drying platform where they remained until reached 11% of humidity. Microbial counts were found in all samples during fermentation and drying of the coffee beans. Counts of fungi in the coffee cherries collected from the tree (time 0) were around 1.5 x 10³ CFU/g. This number increased slowly during the fermentation and drying reaching values of 2 x 10(5) CFU/g within 22 days of processing. Two hundred and sixty three isolates of filamentous fungi were identified. The distribution of species during fermentation and drying was very varied while there was a predominance of Aspergillus species during storage period. The genera found were Pestalotia (4), Paecelomyces (4), Cladosporium (26), Fusarium (34), Penicillium (81) and Aspergillus (112) and comprised 38 different species.